Bugün öğrendim ki: Son evrensel ortak ata (LUCA), yaşamın üç alanı olan Bakteriler, Arkeler ve Ökaryaların ortaya çıktığı varsayılan ortak ata hücresidir.
Dünyadaki tüm mevcut yaşamın en son ortak atası (LUCA)
Burada LUCA'ya yönlendiriliyor. Diğer kullanımlar için bkz. Luca.
Son evrensel ortak ata (LUCA), Bakteriler, Archaea ve Ökaryotlar olmak üzere yaşamın üç alanının köken aldığı varsayımsal ortak ata hücredir. Hücrenin bir lipid çift tabakası vardı; DNA veya RNA'dan proteine çevirme görevini üstlenen genetik kodu ve ribozomları vardı. LUCA muhtemelen en geç 3,6 milyar yıl önce ve muhtemelen 4,3 milyar yıl önce veya daha önce yaşamış olabilirdi [2]. Bu ayrılma noktasının veya aşamasının doğası araştırma konusu olmaya devam etmektedir.
Bu ayrılmadan önceki tüm yaşam biçimleri ve tüm mevcut organizmalar genel olarak ortak bir ata paylaştığı düşünülmektedir. Resmi bir istatistiksel test temelinde, evrensel ortak ata (UCA) teorisi, rekabet eden çoklu ata hipotezlerine karşı desteklenmektedir. İlk evrensel ortak ata (FUCA), LUCA ve şu anda yok olmuş diğer kardeş soy hatlarının varsayımsal hücresel olmayan atasıdır.
Virüslerin ortaya çıkışının LUCA'dan önce mi yoksa sonra mı gerçekleştiği, aynı zamanda mevcut virüslerin ve konukçularının çeşitliliği araştırma konusu olmaya devam etmektedir.
LUCA'nın fosil kanıtı bulunmazken, tüm mevcut yaşamın (üç alana ayrılmış) detaylı biyokimyasal benzerliği, biyokimyacılar tarafından yaygın olarak kabul edilmesini sağlıyor. Özellikleri, modern genomların paylaşılan özellikleriyle çıkarılabilir. Bu genler, DNA'dan mRNA'ya ve proteini dönüştürmek için transkripsiyon ve translasyon mekanizmaları da dahil olmak üzere, birçok uyumlu özelliğe sahip karmaşık bir yaşam formu tanımlar.
Tarihsel arka plan
[düzenle]
Daha fazla bilgi: Yaşam Ağacı (biyoloji)
Bir filogenetik ağaç, tek bir atadan gelen evrim fikrini doğrudan gösterir [3]. İlk yaşam ağacı, Jean-Baptiste Lamarck tarafından 1809'daki Philosophie zoologique eserinde çizilmişti [4] [5]. Charles Darwin daha ünlü olarak, 1859'daki Türlerin Kökeni kitabında evrimsel bir süreç yoluyla evrensel ortak soydan gelen teoriyi önerdi: "Dolayısıyla, benzetimden hareketle, muhtemelen dünyanın üzerinde yaşamış tüm organik varlıkların, yaşama ilk nefes verildiği birincil biçime dayandığını varsaymalıyım." [6] Kitabın son cümlesi, hipotezin yeniden ifade edilmesiyle başlıyor:
Hayatın bu bakış açısında, çeşitli güçleriyle, başlangıçta birkaç biçimde veya birinde soluklandırılarak ortaya çıktığı görüşünde büyüklük var...
"Son evrensel ortak ata" veya "LUCA" terimi, böyle bir ilkel organizma için 1990'larda ilk kez kullanıldı [7] [8] [9].
LUCA'nın özelliklerinin çıkarılması
[düzenle]
Bir anaerobik termofil
[düzenle]
Daha fazla bilgi: Filogenetik parantezleme
2016'da Madeline C. Weiss ve meslektaşları, birçok filogenetik ağacı temsil eden sıralanmış prokaryotik genomlardan 6,1 milyon protein kodlayan gen ve 286.514 protein kümesini genetik olarak analiz etti ve muhtemelen LUCA'ya ortak olan 355 protein kümesini belirledi. Analiz sonuçları oldukça spesifik olmasına rağmen tartışmalıdır. LUCA'yı "anaerobik, CO2-sabitleyen, H2'ye bağımlı, Wood–Ljungdahl yoluna sahip (indirgemeli asetil-koenzim A yolu), N2-sabitleyen ve termofilik" olarak tasvir ediyorlar. LUCA'nın biyokimyası FeS kümeleri ve radikal reaksiyon mekanizmalarıyla doludur." [11] Kofaktörler ayrıca "geçiş metallerine, flavinlere, S-adenosil metionine, koenzim A'ya, ferredokse, molibdopterine, korinlere ve selenyuma bağımlılığı" ortaya koyuyor. Genetik kodu, nükleosit modifikasyonları ve S-adenosil metionin bağımlı metilasyonları gerektiriyordu." [11] Araştırmacılar, incelenen 355 protein soyunda metan üreten klostridiylerin filogenetik ağacın köklerine yakın temel olduğunu ve bu nedenle LUCA'nın okyanus suyunun okyanus tabanının altındaki sıcak magmayla etkileşime girdiği, H2, CO2 ve demir açısından zengin jeokimyasal olarak aktif bir ortamda anaerobik hidrotermal bir vent ortamında yaşamış olabileceğini gösteriyorlar [11]. LUCA'nın ayrıca ters eksik Krebs döngüsü yoluyla H2 ve CO2'den büyüdüğü bile çıkarılıyor [12]. LUCA'da çıkarılan diğer metabolik yollar pentoz fosfat yolu, glikoliz ve glukoneogenezdir [13]. Filogenetik kanıtlar bir termofilik LUCA için hidrotermal bir vent ortamına işaret etse de, bu yaşamın kökeninin hidrotermal bir ventte gerçekleştiği anlamına gelmez, çünkü kitlesel yok oluşlar daha önceki yaşam dallarını ortadan kaldırmış olabilir [14].
LUCA'nın kaba anatomisi büyük bir belirsizlik içinde yeniden yapılandırılabilirken, biyokimyasal mekanizmaları, Dünya'da bağımsız olarak yaşayan tüm organizmalar tarafından şu anda paylaşılan "evrensel" özelliklere dayanarak bazı ayrıntılarla tanımlanabilir [15].
LUCA'nın kesinlikle genleri ve genetik kodu vardı [10]. Genetik materyali muhtemelen DNA'ydı [15], böylece RNA dünyasından sonra yaşamış oldu [a] [18]. DNA, yapısını ve yönünü tanıyan bir enzim olan DNA polimeraz tarafından çift zincirli tutuldu [19]. DNA'nın bütünlüğü, DNA topoizomeraz da dahil olmak üzere bir dizi onarım enzimleri tarafından korunurdu [20]. Genetik kod çift zincirli DNA'ya dayanıyorsa, bilgi tek zincirli RNA'ya kopyalanarak ifade edildi. RNA, DNA'ya benzer nükleotitler kullanan bir DNA bağımlı RNA polimerazı tarafından üretildi [15]. DNA bağlayıcı proteinleri, histon katlantı proteinleri gibi, vardı [21]. Genetik kod proteinlere çevrildi. Bunlar, ribozomlar, taşıyıcı RNA'lar ve ilgili bir grup protein mekanizması aracılığıyla bir haberci RNA'nın translasyonu ile 20 serbest amino asitten birleştirildi [15].
LUCA, nüfus bireyleri arasında genetik rekombinasyonu kolaylaştırmak için DNA transferini teşvik eden uyarlamalı gen işlevlerinin varlığı anlamında cinsel etkileşime girebilirdi. Bakterilerde RecA proteini, archaelerde RadA proteini ve ökaryotlarda Rad51 ve Dmc1 proteinleri gibi homolog gen ürünleri genetik rekombinasyonu teşvik eder [22].
LUCA'nın işlevselliği ve zarla ilişkili biyolojik sistemlerin erken evrimi için kanıtlar birlikte, LUCA'nın hücresellik ve hücre zarlarına sahip olduğunu göstermektedir [23]. Hücrenin kaba yapısı hakkında, lipid çift tabakalı zarla etkili bir şekilde kaplanmış su bazlı bir sitoplazmaya sahipti; hücre bölünmesiyle çoğalabilirdi [15]. Özel iyon taşıyıcıları (veya iyon pompaları) aracılığıyla sodyumu dışarı atıp potasyumu yoğunlaştırma eğiliminde oldu. Hücre, tüm içeriklerini kopyalayıp ardından hücre bölünmesiyle çoğaldı. Hücre, kemiosmozu enerji üretmek için kullandı. Ayrıca CO2'yi indirgedi ve H2'yi (metanogenez veya asetogenez) asetil-tiyoesterler yoluyla oksitledi [24] [25].
Filogenetik parantezlemeyle, varsayılan LUCA'nın yavru gruplarının analizi, LUCA'nın küçük, tek hücreli bir organizma olduğunu gösteriyor. Muhtemelen hücre içinde serbestçe yüzen halka şeklindeki bir DNA sarmalına sahipti. Morfolojik olarak, küçük modern bakteri popülasyonunda öne çıkmayacaktı. Üç alan sisteminin mucidi Carl Woese, genetik makinelerinde LUCA'nın "üç [alana] (ve soydaşlarına) yol açan bireysel atalardan daha basit, daha ilkel bir varlık olacağını" belirtti [1].
"Evrensel" özelliklerin aranmasına alternatif, genom analizini filogenetik olarak eski genleri tanımlamak için kullanmaktır. Bu, jeokimyasal olarak sert bir ortamda yaşayabilen ve modern prokaryotlara benzer bir LUCA resmini verir. Biyokimyasal yolların analizi de filogenetik analizle aynı kimyayı ima ediyor. Weiss ve meslektaşları, "Deneyler... gösteriyor ki... asetil-CoA yolu [anaerobik solunumda kullanılan kimyasallar] format, metanol, asetil grupları ve hatta piruvat, CO2, yerel metaller ve sudan kendiliğinden ortaya çıkıyor" diye yazıyorlar; hidrotermal ventlerde mevcut bir kombinasyon [10].
Bir deney, Zn2+, Cr3+ ve Fe'nin asidik koşullarda eski bir anabolik yol olan ters Krebs döngüsünün 11 reaksiyonunun 6'sını tetiklediğini gösteriyor, bu da LUCA'nın hidrotermal ventlerde veya asidik metal açısından zengin hidrotermal alanlarda yaşamış olabileceğini ima ediyor [26].
Hem bakteriler hem de archaelerin fosfolipidlerin ve hücre duvarının yapısında, iyon pompalamasında, DNA replikasyonunda yer alan çoğu proteinlerde ve glikolizde farklılıklar olması, LUCA'nın iyon pompası olmayan geçirgen bir zara sahip olduğunu gösteriyor. Na+/H+ antiporterlerinin ortaya çıkışı muhtemelen ökaryotlarda, archaelerde ve bakterilerde bulunan geçirmez zarların evrimine yol açtı. "Glikolizin, glukoneogenez olmadan geç ve bağımsız evriminin, LUCA'nın sızıntılı zarlardan doğal proton gradyenleri ile çalışmasıyla tamamen tutarlı olduğu" belirtiliyor. Birkaç uyumsuz özellik, özellikle zardan ve DNA replikasyonundan bağımlı olan hücre duvarının, LUCA'nın geç evrimsel süreçlerine bağlıdır" [27]. LUCA'nın muhtemelen DNA'sı vardı, ancak DNA'yı çoğaltabileceği bilinmiyor ve "sadece RNA tabanlı replikasyon için kimyasal olarak kararlı bir depo olmuş olabilir" deniliyor [10]. LUCA'nın geçirgen zarının muhtemelen archaeal lipidlerden (izoprenoidler) ve bakteriyel lipidlerden (yağ asitlerinden) oluştuğu muhtemeldir. İsoprenoidler, LUCA'nın zarının çevresindeki aşırı habitattaki stabilizasyonunu artırmış olurdu. Nick Lane ve işbirlikçileri, "Farklı mikro ortamlarda hücre zarlarına izoprenoidler eklemenin avantajları ve dezavantajları, zar farklılaşmasını yönlendirmiş olabilir; daha sonra fosfolipid biyosentezi, archaelerin benzersiz G1P ve G3P baş gruplarına ve sırasıyla bakterilerin baş gruplarına yol açmıştır. Eğer bu doğruysa, zar izoprenoidler tarafından sağlanan özellikler, yaşamın kökeni kadar erken bir dönemde lipid ayrılığını konumlandırır" [28].
2024 tarihli bir çalışma, LUCA'nın genomunun modern prokaryotlarınkine benzer bir boyuta sahip olduğunu, yaklaşık 2.600 protein kodladığını; anaerobik olarak solunduğunu ve asetogen olduğunu; ve erken bir CAS tabanlı antiviral bağışıklık sistemine sahip olduğunu öne sürüyor [29].
Alternatif yorumlamalar
[düzenle]
Bazı diğer araştırmacılar, Weiss vd.'nin 2016 sonuçlarını sorgulamaktadır. Sarah Berkemer ve Shawn McGlynn, Weiss vd.'nin protein ailelerini yeterince örnek almadığını, bu nedenle filogenetik ağaçların eksik olduğunu ve proteinlerin evrimini doğru bir şekilde tanımlamadığını savunmaktadır. LUCA'nın ortamını hemen hemen evrensel gen dağılımından (Weiss vd. 2016 gibi) atfetme girişiminde iki risk vardır. Bir yandan, yakınsama veya yatay gen transferi olaylarını dikey inişe yanlış atfetme riski vardır; diğer yandan, olası LUCA gen ailelerini yatay gen transferi olayları olarak yanlış atfetme riski vardır. Muhtemelen LUCA'ya izlenen bir dizi proteinin filogenomik ve jeokimyasal analizi, K+-bağımlı GTPazlara sahip olduğunu ve hücre içi sıvısının iyonik bileşiminin ve konsantrasyonunun görünüşte yüksek K+/Na+ oranı, NH4+, Fe2+, CO2+, Ni2+, Mg2+, Mn2+, Zn2+, pirofosfat ve PO3-4 olduğunu gösteriyor ki bu da kara sıcak su kaynağı bir yaşam ortamı anlamına geliyor. Muhtemelen fosfor bazlı bir metabolizmaya sahipti. Dahası, bu proteinler otokopya (bir organizmanın kendi organik madde üretme yeteneği) ile ilgili değildi, bu da LUCA'nın hetero-trofik bir yaşam tarzına (organik madde tüketme) sahip olduğunu ve büyümesinin fiziksel çevre tarafından üretilen organik maddelere bağlı olduğunu gösteriyor [30]. Nick Lane, Na+/H+ antiporterlerinin LUCA'daki ve soydaşlarındaki düşük Na+ konsantrasyonunu kolayca açıklayabileceğini savunmaktadır.
LUCA'daki enerji işleme enzimleri CODH/asetil-koenzim A sentazının varlığı, sadece ototrof olmakla kalmayıp, aynı zamanda karışık bir besin türü (miksotrof) veya hetero-trof olarak yaşamla da uyumlu olabilir [31]. Weiss vd. 2018, hiçbir enzimin bir besin tarzını tanımlamadığını ve heterotrofların ototroflardan evrimleştiğini söylüyor [10].
LUCA'nın mezofilik olduğuna dair kanıtlar
[düzenle]
Şu anda birçok kanıt, LUCA'nın termofilik olmadığını öne sürüyor.
G + C nükleotit çiftlerinin içeriği (A + T çiftlerinin ortaya çıkışına kıyasla), bir organizmanın termal optimumunu gösterebilir, çünkü ek bir hidrojen bağı nedeniyle daha termal olarak kararlıdırlar. Sonuç olarak, termofillerin rRNA'sında daha sık görülürler; ancak LUCA'nın yeniden oluşturulan rRNA'sında görülmez [32] [33] [14].
LUCA'da termofilik genlerin saptanması eleştiriliyor [34], çünkü bunlar bunun yerine daha sonraki archaelerde veya bakterilerde evrimleşen, daha sonra yatay gen transferi yoluyla bu iki organizma arasında göç eden genler olabilir, tıpkı Woese'nin 1998 hipoteğinde olduğu gibi [35]. Örneğin, termofilik spesifik topoizomeraz olan ters giraz, daha önce LUCA'ya atfediliyordu [11], ancak kapsamlı bir filogenetik çalışma, bu enzimin daha yakın bir kökene sahip olduğunu ve ardından yoğun yatay gen transferi yoluyla ortaya çıktığını gösterdi [36]. LUCA, CO2'yi sabitleyen ve H2'ye dayanan mezofil olabilirdi ve hidrotermal ventlerin yakınında yaşıyordu [37].
LUCA'nın mezofilik olduğuna dair başka bir kanıt, proteinlerinin amino asit bileşiminden geliyor. Bir organizmanın proteinlerinde IVYWREL (I, V, Y, W, R, E ve L amino asitlerinin bolluğu) miktarı, optimal büyüme sıcaklığıyla ilişkilidir [38]. Filogenetik analizlere göre, LUCA'nın proteinlerinin IVYWREL içeriği, ideal sıcaklığının 50°C'nin altında olduğunu göstermektedir [14].
Son olarak, hem bakterilerin hem de archaelerin bağımsız olarak artan ve daha sonra azalan termo-tolerans aşamalarından geçmesi, her iki popülasyonu da etkileyen ve görünürdeki genetik termo-tolerans genlerinin yaygınlığını açıklayan dramatik bir LUCA sonrası iklim değişikliğini göstermektedir [39].
Yaş
[düzenle]
2000 ile 2018 yılları arasındaki çalışmalar, LUCA için giderek daha eski bir zaman öne sürdü. 2000 yılında LUCA'nın yaşı Paleoarkaik dönemde 3,5 ila 3,8 milyar yıl öncesiydi [40], yaşamın ilk fosil kanıtlarından birkaç yüz milyon yıl önce. Adaylar 3,48 ila 4,28 milyar yıl öncesinde değişiyordu [41] [42] [43] [44] [45]. Bu, ilk yaşam formlarının Geç Ağır Bombardıman'dan kısa bir süre sonra ortaya çıktığını gösteriyordu, bu da Dünya yüzeyini tekrar tekrar sterilize ettiği düşünülüyordu. Ancak, 2018'de Holly Betts ve meslektaşları, genom ve fosil kayıtlarına (102 tür, 29 ortak protein kodlayan gen, çoğunlukla ribozomlar) moleküler saat modeli uygulayarak LUCA'nın Geç Ağır Bombardıman'dan önce geldiğini (LUCA'nın 3,9 milyar yıldan fazla önce olduğunu) buldu [46]. 2022 tarihli bir çalışma, LUCA için yaklaşık 3,6-4,2 milyar yıllık bir yaş önerdi [47]. 2024 tarihli bir çalışma, LUCA'nın yaklaşık 4,2 milyar yıl önce yaşadığını (güven aralığı 4,09-4,33 milyar yıl önce) öne sürdü [29].
Yaşam ağacının kökü
[düzenle]
Bakteri filumlarının dallanması için bkz. Bakteri filumları.
1990'da yaşam ağacı için yeni bir kavram sunuldu, canlı dünyayı Bakteriler, Archaea ve Ökaryotlar alanları olarak sınıflandırılan üç gövdeye ayırdı [1] [49] [50] [51]. Sadece moleküler filogenetiklere dayalı ve mikroorganizmaların evrimini içeren ilk ağaçtır. Bir "köklü evrensel filogenetik ağaç" olarak adlandırılmıştır [1]. Bu ağaç ve kökeni tartışma konusu olmuştur [49] [b].
Bu arada, özellikle yatay gen transferinin kökeni ve erken dallanması için rolü ve önemiyle ilgili olarak, bu ağacın birçok değişikliği önerilmiştir (örn. [53] [48]). Mirası hem dikey hem de yatay olarak gerçekleştiğinden, yaşam ağacı erken aşamasında daha ağ benzeri veya ağ benzeri olabilir ve üç gövdeli bir ağaç halini aldığında daha ağaç benzeri olabilir [48]. Tahmin edilebilir ki yatay gen transferi, hücre stabilitesi artınca azalmıştır [54].
Birkaç moleküler çalışmaya dayanan ağaçtaki değiştirilmiş versiyonun kökü, tek bir dallanmış Bakteri alanı ve Archaea ve Ökaryotlar'dan oluşan bir taksonun arasında bulunmaktadır [53]. Çalışmaların küçük bir azınlığı, kökün Bakteriler alanındaki Bacillota filumunda olduğunu [55] veya Chloroflexota filumunun (önceden Chloroflexi) Archaea ve Ökaryotlar ve geri kalan bakteriler ile oluşan bir taksona temel olduğunu (Thomas Cavalier-Smith tarafından önerildiği gibi) belirtiyor [56]. Metagenomik analizler, Archaea ve Bakteriler alanlarını içeren iki alan sistemi geri kazanıyor; bu yaşam ağacı görüşünde, Ökaryotlar Archaea'dan türemiştir [57] [58] [59]. Daha sonra LUCA'nın soydaşlarının gen havuzunda, AT/GC kuralı ve standart yirmi amino asidin ortak bir çerçevesi paylaşılınca, yatay gen transferi mümkün hale gelmiş ve yaygınlaşmış olabilirdi [60].
LUCA'nın doğası tartışılıyor. 1994'te, ilkel metabolizma (Wächtershäuser anlamında) temelinde, Otto Kandler, üç yaşam alanının ardışık ayrılmasını, kademeli evrimsel iyileştirmelerle (hücreselleşme) ulaşılmış çokfenotipli bir ön-hücre populasyonundan önerdi [61] [62] [63]. Bu fenotipik olarak çeşitli ön-hücreler, sıklıkla genetik bilgi alışverişinde bulunan metabolize edip, kendilerini çoğaltan varlıklardı. Böylece, bu senaryoda "ilk hücre" yoktu. Bu, birliğin ve aynı zamanda yaşamın üç çizgisine (üç alan) bölünmesini açıklayabilir. Kandler'in ön-hücre teorisi Wächtershäuser tarafından destekleniyor [64] [65]. 1998'de Carl Woese, RNA dünyası kavramına dayanarak, hiçbir bireysel organizmanın LUCA olarak kabul edilemeyeceğini ve tüm modern organizmaların genetik mirasının eski bir organizma topluluğu arasında yatay gen transferi yoluyla elde edildiğini öne sürdü [66]. Diğer yazarlar, LUCA zamanında "karmaşık bir kolektif genom" [67] olduğunu ve yatay gen transferinin sonraki grupların evriminde önemli olduğunu kabul ediyor; Nicolas Glansdorff, LUCA'nın "metabolik ve morfolojik olarak heterojen bir toplulukta, sürekli olarak genetik materyali karıştırmakta olduğunu ve bu karışıklığın sürdüğü sürece evrimsel bir varlık olmaya devam ettiğini" belirtti [68].
Yaşamın evrensel ortak atası teorisi yaygın olarak kabul ediliyor. 2010'da, "şimdi tüm yaşam alanlarından elde edilen çok sayıda moleküler diziden" [69] yararlanarak, D. L. Theobald evrensel ortak ata (UCA) için "resmi bir test" yayınladı. Bu, tüm mevcut karasal organizmaların uzak geçmişte tek bir türe ait tek bir türün soyundan gelen soyunun ortak kökenini ele almaktadır. Resmi testi, yatay gen transferini de içeren geniş bir alternatif hipoteze göre evrensel ortak atanın varlığına destek verdi. Temel biyokimyasal ilkeler, tüm organizmaların ortak bir ataya sahip olduğunu ima ediyor [70].
LUCA'ya önerilen, daha önceki, hücresel olmayan bir atası, İlk evrensel ortak ata (FUCA)'dır [71] [72]. Bu nedenle FUCA, modern her hücrenin yanı sıra LUCA'nın soyundan gelmeyen eski, şimdi yok olmuş hücresel hatların atası olacaktı. FUCA'nın LUCA'dan başka soydaşları vardı; bunlardan hiçbiri modern soydaşlara sahip değildi. Bu eski, şimdi yok olmuş hücre hatlarının bazı genlerinin, LUCA'nın erken soydaşlarının genomuna yatay olarak aktarıldığı düşünülüyor [60].
LUCA ve virüsler
[düzenle]
Virüslerin kökeni tartışmalıdır. Virüsler çoğalmak için konakçı hücrelere ihtiyaç duydukları için, hücrelerin oluşumundan sonra ortaya çıkmışlardır. Virüslerin hatta çok sayıda kökeni olabilir ve farklı virüs türleri yaşamın tarihinde bağımsız olarak evrimleşmiş olabilir [51]. Örneğin, RNA dünyasından erken bir virüs kökeni veya bencil DNA'dan daha sonraki bir virüs kökeni gibi virüslerin kökeni için farklı hipotezler vardır [51].
Virüslerin şu anda bakteriler ve archaeler arasında nasıl dağıtıldığını düşünürsek, LUCA'nın, bugün bu iki alanda konukçu olan virüslerin ataları tarafından avlandığına inanılıyor [73]. Dahası, kapsid proteinlerinin jel-rulo yapısının tüm üç yaşam alanındaki RNA ve DNA virüslerinde paylaşıldığı için, LUCA'dan önce geniş kapsamlı bir virüs evrimi gerçekleşmiş görünüyor [74] [75]. LUCA'nın virüsleri, Duplodnaviria ve Varidnaviria adı verilen gruplarda muhtemelen ağırlıklı olarak çift zincirli DNA virüsleriydi. Monodnaviria içindeki iki tek zincirli DNA virüsü grubu olan Microviridae ve Tubulavirales muhtemelen son bakteri ortak atasını enfekte etmişti. Son archaeal ortak atası muhtemelen ipliksi virüsleri barındırıyordu. Bütün bunlar LUCA'yı etkileyebiliyordu, bu durumda her biri konakçı alanda artık mevcut olmadığı için kaybolmuş olmalıdır. Buna karşılık, RNA virüsleri, doğrudan RNA dünyasından türemiş RNA virüsleriyle başlamış gibi düşünülebilen, LUCA'nın önemli parazitleri gibi görünmüyor. Aksine, LUCA yaşadığında RNA virüsleri muhtemelen DNA virüsleri tarafından yenilmişti [73].
LUCA, bazı virüslerin atası olabilir, çünkü en az iki soydaşa sahipti: LUCELLA, tüm hücrelerin atası olan Son Evrensel Hücresel Ata ve büyük-orta büyüklükteki DNA virüslerinin atası olan antik virosel ata [76]. Azalma hipotezi uyarınca, dev virüslerin parazitik hale gelen ilkel hücrelerden evrimleşmesi ile virüsler LUCA'dan önce ancak İlk evrensel ortak atanın (FUCA) sonra evrimleşmiş olabilir [60].
Ayrıca bakınız
[düzenle]
Hücreselleşme - Hücrelerin kökenini ve oluşumunu açıklayan bilimsel teori
Kimoton - Yaşamın temel birimi için soyut model
Darwinci eşiğin aşılması - İlk hücrelerin evriminde yaşanan dönem
Son ökaryotik ortak ata - İlk ökaryotik hücrenin oluşum süreciSayfalar, yönlendirme hedeflerinin kısa açıklamalarını gösterir
Ön-hücre - Tamamen oluşmuş hücrelerden önceki olası yaşam
Ön-metabolizma - Modern metabolizmaya dönüşen kimyasal reaksiyonlar
Yaşamın evrimsel tarihçesi zaman çizelgesi
Urmetazoan - Tüm hayvanların son ortak atası
Notlar
[düzenle]
Referanslar
[düzenle]
Daha fazla okuma
[düzenle]